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2000年，新的KOF大赛召开了。不用说，这背后又有一个天大的阴谋。看多了奇怪的剧情，这一代的就有些淡然无味了。倒是冰雪少女库娜的出现，让人眼前一亮，有点惊艳的感觉。故事仍是与NESTS的战争，而且看不出已近最终决战。结局……自然是阴谋家ZERO在一番并不激烈的反抗后被主角们打倒了……KOF2000，是SNK公司的颠峰之作，是难以正确评估的一代。从画面的精致上来看，无疑是超越了前作。从招式的华丽上来看，也超越了前作。但是却有许多人对其评价低下，只因无法适应改进的护援模式。这样一部空前的作品，只怕也是绝后的——它的护援角色竟比战斗角色还要多，简直有主次不分的感觉。而随时可以呼叫护援的设计，又让一丝血战胜满血成了常事。在这个游戏中，善用护援成了头等大事，本身的战斗力倒被许多人忽略了，应该说，违背了格斗游戏的理念。
通用操作方法：A：轻拳B：轻腿C：重拳D：重腿
前冲：→→后退：←←
小跳跃：向上方短按↖或↑或↗
中跳跃：冲刺中按↖或↑或↗
大跳跃：冲刺中按住↖或↗
防卫并紧急回避-前方：防卫中→+AB同时按（消费能量）
防卫并紧急回避-后方：防卫中←+AB同时按（消费能量）
特殊攻击：CD同时按
防卫并特殊攻击：防卫中CD同时按（消费能量）
防卫弹开：给与防卫中的对手一定时间的连续攻击
投技：前行靠近对方→+C
受身：倒地前按AB同时按
STRIKER系统：BC同时按“可得到同伴的帮助”
反击模式：ABC同时按，效果：人物闪红色“可无限制使用超必杀，必杀技可接超必杀(且必杀技威力增强)”
装甲模式：BCD同时按，效果：人物闪黄色“防卫超必杀不减血、受到攻击不[太]后退、可移动攻击”
挑拨对手：START键
KOF2000恢复了传统的紧急回避，取消了闪后进攻。游戏速度进一步的整体提高。反击模式和防护模式没有太大的变化。防护模式的时间增长了，反击模式和防护模式的轻击造成的硬直相当于以前重击造成的硬直。模式发动时会轰飞靠近的对手。而KOF2000最大的特点是STRIKER MATCH系统的增强。攻击中通常技或必杀技、通常投、解拆投技、倒地前都可以呼叫援助。也使得连续技的华丽程度成为KOF系列之最。
二零零零年——就像N.E.S.T.S组织预料的一样，全球的恐怖事件正一轮接一轮的展开着。与此同时哈迪兰上校（Heidern）与他的部下觉得事情与K'，Maxima他们两人有关，并策划去调查他们。正当哈迪兰上校准备跟踪K'与Maxima时却得知令一场格斗比赛即将开幕，《格斗之王2000》争霸赛。世界各地的格斗家收到了邀请卡准备全力应战，但是他们万万没想到的是K'与Maxima也在队伍中。此外，神秘组织N.E.S.T.S所发出的邀请卡意味着第二阶段的计划已经开始了。神秘组织N.E.S.T.S的行动是个巧合？又或者是……？只有时间才能证明这一切。就像暴风雨之前的平静，混乱即将开始！拳皇大赛又开幕了.就在大赛快要结束的时候，ZERO杀死了巴西佣兵指挥官凌先生，放置了克隆人在海顿身边，最后用等离子大炮想叛变N.E.S.T.S......
