《口袋妖怪守护者2融合》是《口袋妖怪守护者》的续篇，是在NDS上的动作冒险游戏，于2008年3月20日在日本发售。与前作类似，守护者们的【捕获】具体到游戏操作上就是拿触摸笔对着下屏上的口袋妖怪画圈。那些口袋妖怪则会四处移动/发动各种攻击干扰捕捉，减少你捕捉碟的能量。
《口袋妖怪守护者2·融合》的流程比前作增长了许多，还加入了60个支线委托任务，这些委托任务得到的奖励可以强化陀螺、增加搭档口袋妖怪、也和口袋妖怪系列经典要素——收集图鉴息息相关。另外本作中还有更多的特别任务存在，可以用来传送沧海的王子玛娜菲的蛋、达库莱、会波**的里奥鲁到口袋妖怪钻石珍珠白金中。
和口袋妖怪们一起，利用手中的触摸笔拯救阿尔米亚地区，让阿尔米亚地区重现和平吧。
故事在阿尔米亚地方展开。故事开始时，玩家在守护者学校入学，在完成基础任务之后，就会毕业。
玩家会在开始时选择性别，然后决定名字，默认的名字分别是小初和小瞳。
玩家在从守护者学校毕业之后，会拥有自己的搭档口袋妖怪，随着完成特定的委托，就会增加搭档口袋妖怪，分别是小卡比兽，草苗龟，小火焰猴，波加曼，圆法师，魔尼尼，头盖龙，盾甲龙，不良蛙，腕力，帕奇利兹，姆克儿，怪河马，雪笠怪，梦妖，狃拉和圆陆鲨，一共17种，分别对应了17种基本属性。
反派组织是暗暗队。暗暗队通过遥控装置控制口袋妖怪的行动。
玩家可以乘坐在口袋妖怪上横渡河流、海沟或者冰山。
可以通过守护者网络下载特别任务，可以借此获得玛纳霏的蛋（现在已经无法下载）。
