《超级机器人大战J》是由Banpresto公司开发的一款SRPG，战棋类游戏。本作以宇宙时代，人类的生活圈超越了地球周边宙域并拓展到火星一带为背景，在与不明对方原形的木星蜥蜴的战乱以及プラント和地球联合高涨的紧张对立中，开始了一场战斗。
宇宙时代，人类的生活圈超越了地球周边宙域并拓展到火星一带。可是包括地球环境恶化等，好几个人类从以前就存在的问题至今也没有被解决：根据遗传基因调整被生出的新人类“新人类（CO）”的出现；屡次发生的地壳变动的原因，是在深海处被发现并命名为“ァ‰ファン”的异星文明遗迹；还有对火星的殖民。
人们对新的时代还是充满了期待，不过，太急剧的变化产生出对这一切的适应者和拒绝反抗的人。因为那个能力而被赶走到宇宙的新人类们建设了殖民卫星“プラント”。但是在新人类自身的统治下，害怕被分离的自然人反对プラント的独立，严重加深了与新人类之间的对立。还有就是“ァ‰ファン”不知不觉称中被自称为“リクレマー”的人们进入，这个信息对大众加以了掩盖。
宇宙纪元69年
突然从木星方向飞来了谜般的无人兵器对火星展开了侵略。在火星圈的大规模会战中失败的联合军在许多人还留在火星的情况下，决定将军队撤离。而这些被称呼为“木星蜥蜴”的神秘侵略者向地球圈送去了无敌“郁金香”（推测可能是敌人的母舰），之后从那里面不断出现敌人的兵器，地球圈进入了和敌人持久作战的状态。
地球上的战斗也是屡次发生，趁着混乱时期为达到自己的目而开始活动的人也相继出现。在这中，提出独立自卫策略的プラント的行动被视作是对宗主国的叛乱，以大西洋联邦作为核心的地球联合各国以实力对新人类予以制裁的要求声高涨了。
宇宙纪元70年
现在，在与不明对方原形的木星蜥蜴的战乱以及プラント和地球联合高涨的紧张对立中，ネルガル重工独自建造的新型战列舰“ナデシコ”的完成，故事从这里开始了…
高性能レーダー 地图兵器、射程1以外武器射程+1
オールレンジレーダー 地图兵器、射程1以外武器射程+2
高性能照准器 机体持的所有武器命中率+30%
マルチロックァ◇SYS 机体持的所有武器命中率+20%
スナイパースコ-プ 机体持的所有武器命中率+10%
超高性能OS 全武器CT（必杀一击）补正+30
高性能OS 全武器CT（必杀一击）补正+20
学习型OS 全武器CT（必杀一击）补正+10
EN チップ 武器EN消费减少10%，不可重复安装
EN メガチップ 武器EN消费减少20%，不可重复安装
EN ギガチップ 武器EN消费减少30%，不可重复安装
大型マガジン 全武器弹药数1.5倍，不可重复安装
超大型マガジン 全武器弹药数2倍， 不可重复安装
1 除了以下强制的关卡外，其他时候不能派天之志雷马出战
2 所有八卦众需要由天之志雷马亲自击破，不能用援护攻击，地图武器，连击武器击破
第10话 [暗之胎动]后，选择“留在抚子号”
第13话 [2台魔神]里，天之志雷马击破风之兰士达
第20话[“真相”并非只有一个 ]后，选择“留在地面上”
第21话 [欧凡抗体]里，天之志雷马击破水之加罗幸尔与火之布拉尔丝多
第29话 [地狱城的激斗！]里，天之志雷马击破月之罗兹圣拿比
第31话 [命运之楔]后，选择“留下”
第32话 [怨念的终焉]里，天之志雷马击破雷之奥姆渣古，地之迪洛迪丝和山之巴士顿
达到以上条件的话，幽罗帝会驾驶真·志雷马出战，由天之志雷马击破
第36话 [玻色子跳跃]开始时，秋津正人就会驾驶真·志雷马加入
P.S：上述关卡出现的八卦众需要由天之志雷马击破外，其他关卡出现时不需要由天之志雷马击破
底力：随HP下降，命中率、回避率、装甲及CT发动率均上升
斩り払い：实弹系武器伤害为0，需要机体拥有剑装备
撃ち落し：实弹系武器伤害为0，需要机体拥有枪装备
シールド防御：伤害降低50%，需要机体拥有盾装备
カウンター ：反击时先于敌人攻击
ヒット&；アウェイ：原地进行攻击后可进行移动或待机
スーパーモード：机师全能力+10，气力120以上发动
コーディネイター：每上升10的气力，机师全能力+2
IFS：每上升10的气力，机师全能力+2
ブラスター化：机师全能力+10， 移动力+1， ハイコ-トボルテッカ变巍≈ラスターボルテッカ（攻击力增加500），机体运动性装甲提高
SEED：除“穆”及“战舰”的SEED系列人员，机师全能力+10，气力120以上发动
野生化：断空我-忍专有特技，气力120发动，攻击力为通常的1.25倍。
明镜止水：多蒙专有特技，气力120发动，机师全能力+10，移动力+1，机体运动性装甲提高。
抗体反応：灵魂力量系列全员专有特技，LV1无效果，此后LV为偶数的在上一级基础上+2%命中回避率（奇数的+3%），同时每升一级别武器攻击力+50，LV5和LV9时各加一次射程 ，LV9时合计命中率&；回避率+20%，武器攻击力+400，射程+2
指挥
L3：周围4格以内，回避+20%，命中+20% 每远离指挥范围中心附近1格命中回避-4%
L2：周围3格以内，回避+15%，命中+15% 每远离指挥范围中心附近1格命中回避-3%
L1：周围2格以内，回避+10%，命中+10% 每远离指挥范围中心附近1格命中回避-2%
援护攻撃：相邻近机体可进行援护攻击，次数与LV相等
援护防御：相邻近机体可进行援护防御，次数与LV相等，被援护方不会受到伤害，援护的机体伤害减半
コンボ（combo）：可以使用コンボ系列武器（武器名尾部带有 © 符号的武器），攻击相邻的敌人，LV1时可攻击2个，LV3时可攻击4个
