《泡泡龙DS》的游戏模式包含 NDS 和 CLASSICS 两类，各自收录了3种游戏模式。其中的单人游戏模式有以不同的关数划分而成的PUZZLEMODE模式；以计算机角色为对手进行对战的VSCPUMODE模式；不会完结的游戏模式，PUZZLE会不断出现的ENDLESSMODE模式。本作新增了名为 DSSTYLE 的系统，在这系统下，玩家可以储起在游戏中所得到的各种不同功能的道具，并可以自由选择在甚么时候使用那些道具。此外，游戏还设有编辑模式，玩者可以自行设置自己的版图。
键盘控制游戏的方法：
键盘 O + K --- 开始游戏
键盘 任意一个键 --- 继续游戏
键盘 5（6、7、8） --- 投币（注意 5对应1，6对应2，7对应3，8对应4）
键盘 1（2、3、4） --- 开始选人（注意 5对应1，6对应2，7对应3，8对应4）
键盘方向键左和右 --- 选人
键盘左 Ctrl ---确定人选
键盘左 Ctrl --- 攻击
键盘左 Alt --- 跳
键盘方向键 --- 移动（上、下、左、右）
键盘左 Ctrl + Alt --- 绝招（杀死敌人的同时会使自己失血）
该游戏是一款方块益智类游戏。本作的游戏模式包含“NDS”和“CLASSICS”两类，各自收录了3种游戏模式。其中的单人游戏模式有以不同的关数划分而成的PUZZLE MODE模式；以计算机角色为对手进行对战的VS CPU MODE模式；不会完结的游戏模式，PUZZLE会不断出现的ENDLESS MODE模式。本作新增了名为“DS STYLE”的系统，在这系统下，玩家可以储起在游戏中所得到的各种不同功能的道具，并可以自由选择在甚么时候使用那些道具。此外，游戏还设有编辑模式，玩者可以自行设置自己的版图。
