口袋妖怪紫水晶是神奇宝贝系列游戏的第七个作品，它是一年前金银的重制版。它的冒险地区与前作的金银版相同，是城都地区，并且在通关后可以前往关东地区冒险。
主人公在城都地区的若叶镇开始自己的旅行。首先要在空木博士处领取一只初学者神奇宝贝。此时主人公有三个选择：炎系的火球鼠，水系的小锯鳄，草系的菊草叶。之后，玩家就可以开始旅行了。在旅行的途中，需要从坐落于各地的道馆收集八个徽章来获得挑战神奇宝贝联盟的资格，还需要与路上各式各样的训练家和野生神奇宝贝对战，并且收服想要的野生神奇宝贝，组成自己的对战队伍。主人公也需要与邪恶组织火箭队对抗，阻止他们复活的妄想。主人公还可能在游戏中遇见传说中的神奇宝贝，如水君，炎帝与雷公。运气好的话还可以遇见凤王与洛奇亚，这些游戏要素都需要自己去发掘。
火箭队以新面貌再度出现，虽然他们的首领坂木已经不在了。他们在本作中的首要活动地区为城都地方。主人公将在桧皮市首次对抗火箭队，阻止他们切下呆呆兽的尾巴拿去出售。随着剧情的发展，火箭队的阴谋一点一点显现出来。主人公需要捣毁他们在卡吉镇的地下基地，从他们手中夺回被占领的满金广播电塔……
在冒险中，主人公还会碰见从烧焦塔苏醒的一只传说中的神奇宝贝，水君。在这个版本中还有一个新人物，米那君，梦想着能收服水君。
在称霸神奇宝贝联盟之后，主人公可以通过搭乘浅葱市的阿哥号来到关都地方，在这片与城都地方连接在一起的地方再度展开新的冒险。同样，这里也有各式各样的训练家、野生神奇宝贝以及道馆在等待着主人公。集齐十六个徽章之后，主人公将向着城都与关都的分界线处的白银山前进。在那里，小赤正在静静地等待着主人公。
前去击败他吧，你将创造新的传说。
游戏更加适合新手，本身也堪称佳作，但缺少扣人心弦的新要素。口袋妖怪系列虽衰老而反响良好，但依旧带给玩家的依旧是1996年时的体验。她进一步阐述了该作与红蓝宝石版的相似之处，认为该作并非不不可少，但依旧优质，同道馆训练家再战的系统为玩家带来了令人激动的挑战，游戏关于对战开拓区的设定修复了红蓝宝石版中的瑕疵，喜欢的玩家不要错过。
