fc假面忍者花丸汉化版采取的是横版过关模式，游戏本身难度很高，主角花丸属于一击即死型，大大增加了游戏的挑战程度。但BOSS战则改为比较特殊的桌面类战斗。必须一提的是，BOSS战的BOSS牌面是根据玩家进入BOSS战时的时间尾数来决定的。时间影响了BOSS战的难易程度，不过只要玩家在攻关中积累了一定数量的牌数翻倍道具，BOSS战也就没什么难度可言了。
我的名字叫花丸，是一名见习忍者。我和我的爱鸟“秋卡皮”是身边这些小弟弟和小妹妹们的守护者。他们和我一样都是孤儿，我们一起生活在一个名叫快乐岛的美丽天堂般的地方。很早就听说在我们生活的国家存在着一个叫做迷之军团的神秘忍者组织，他们一直对这个天国般的小岛虎视眈眈，不过因为我的存在，他们并没有敢来放肆。有一次我接到了紧急命令而离开了小岛，却没想到我刚刚离开，迷之军团就迅速占领了小岛，还把孩子们全都抓了起来。在火速执行完任务后，我和秋卡皮便立刻踏上了夺回小岛的旅程。而我的冒险故事，也就是从这里开始
小忍卷：增加忍术槽1格
大忍卷：增加忍术槽5格
牌数2倍道具：最多保留七个。BOSS战出牌点数变为2倍。
牌数3倍道具：最多保留上限未知。BOSS战出牌点数变为3倍。
饭团：最多保留一个。BOSS战回复5点体力。
盾牌：最多保留一个。BOSS战完全防御一次。
闪电术：消费10格忍术，攻击全屏敌人。
地震术：消费5格忍术，攻击地面敌人。
火鸟术：消费2格忍术，鸟的攻击加速，距离加长。
轻身术：消费5格忍术，跳跃力和速度上升。
1UP：增加一条生命。
护身徽章：一定时间内无敌，跳跃力和速度上升，不可发动攻击。
迷之军团被打倒了，我救出了这些可爱的孩子们，把欢乐岛又还到了这些他们的手中。看着他们天真、开心的笑容，我的心里也很高兴，虽然我也很舍不得离开他们，可我毕竟是个忍者，我有我的任务。但我发誓，不管什么时候，在什么地方，只要这些孩子们遇到困难，我就一定会再次出现在他们面前来帮助他们。毕竟，他们这个年龄是享受幸福快乐时光的时候，我决不允许有人再来破坏欢乐岛的和平，伤害他们幼小的心灵。这是我的责任……
